Secuenciación de firmas masivamente paralela (MPSS)

La primera de las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, la secuenciación de firmas masivamente paralela (o MPSS), se desarrolló en la década de 1990 en Lynx Therapeutics, una empresa fundada en 1992 por Sydney Brenner y Sam Eletr. MPSS era una operación basada en perlas que utilizaba un complex para la ligadura del adaptador seguida de la decodificación del adaptador, leyendo la concatenación en incrementos de cuatro nucleótidos. Esta operación lo hizo susceptible a un sesgo específico de secuencia o pérdida de secuencias específicas. Con el argumento de que la tecnología era tan complex, Lynx Therapeutics solo realizó MPSS "internamente" y no DNA Se vendieron máquinas secuenciadoras a laboratorios independientes. Lynx Therapeutics se fusionó con Solexa (luego adquirida por Illumina) en 2004, lo que llevó al desarrollo de la secuenciación por síntesis, un método más simple adquirido de Manteia Predictive Medicine, que dejó obsoleto a MPSS. De todos modos, las propiedades esenciales de la salida MPSS eran típicas de los tipos de datos de alto rendimiento posteriores, incluidos cientos de miles de secuencias cortas DNA. En el caso de MPSS, estos se utilizaron habitualmente para secuenciar el ADNc para las medidas de la forma genética de los niveles de expresión.

Imagen 151A | Los análisis de concatenación múltiples y fragmentados deben ensamblarse sobre la base de sus áreas superpuestas. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) de Wikimedia Commons

Imagen 151A | Los análisis de concatenación múltiples y fragmentados deben ensamblarse sobre la base de sus áreas superpuestas. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) de Wikimedia Commons

Autor : Milos Pawlowski

Referencias:

Técnicas de biología molecular I

Herramientas de biología molecular II

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